Unsere Methode

RNA-Extraktion nach Gewebe

Jedes Gewebe bietet ein anderes Fenster zum Immunrepertoire des Lamas. Wir passen die Entnahmequelle an Ihr Projekt an.

Methode

Von der Immunzelle zur RNA, die das VHH-Repertoire kodiert.

Die für VHH-Domänen kodierende RNA wird von den B-Lymphozyten und Plasmazellen des immunisierten Lamas getragen. Diese Zellen verteilen sich auf mehrere Kompartimente — zirkulierendes Blut, sekundäre lymphatische Organe, Knochenmark —, deren Zugänglichkeit und Zusammensetzung der Zelluntergruppen sich unterscheiden.

Die Gewebewahl hängt vom Immunisierungsstadium, der gewünschten Repertoire-Diversität und der Invasivität der Entnahme ab. Für die überwiegende Mehrheit der Projekte genügt peripheres Blut; tiefere lymphatische Gewebe sind spezifischen Anforderungen an Diversität oder Plasmazellreifung vorbehalten.

Gewebequellen

Vier Immunkompartimente, vier Repertoire-Profile.

Peripheres Blut

PBL / PBMC — Standardweg

Periphere Blutlymphozyten (PBL) oder mononukleäre Zellen des peripheren Blutes (PBMC) werden nach jeder Blutentnahme durch Dichtegradientenzentrifugation isoliert. Dies ist die am wenigsten invasive Quelle: Sie kann zu mehreren Zeitpunkten des Immunisierungsplans wiederholt werden, um die Entwicklung des Repertoires über aufeinanderfolgende Auffrischungen zu verfolgen, ohne chirurgischen Eingriff.

Lymphknoten

Hohe B-Zell-Diversität

Lymphknoten sind der Ort, an dem aktivierte B-Lymphozyten reifen. Nach den letzten Auffrischungsimmunisierungen sind sie besonders reich an Plasmazellen, die hochaffine Antikörper produzieren, wodurch Bibliotheken mit bereits durch somatische Hypermutation gereiften Klonen angereichert werden können.

Milz

Lymphatisches Reservoir

Als bedeutendes sekundäres lymphatisches Organ wird die Milz herangezogen, wenn ein tieferer Gewebezugang erforderlich ist, um die Repräsentation des Immunrepertoires zu maximieren, ergänzend oder alternativ zu peripherem Blut.

Knochenmark

Reife Plasmazellen

Das Knochenmark beherbergt langlebige Plasmazellen. Es ist eine ergänzende Quelle für Projekte, die ein Repertoire reifer, zeitlich stabiler Antikörper benötigen, die eine etablierte Immungedächtnis repräsentieren.

Vergleich

Welches Gewebe für welches Ziel?

GewebeInvasivitätDiversität / ProfilAnwendungsfall
Peripheres Blut (PBL/PBMC)Minimal — BlutentnahmeStandard, im Zeitverlauf wiederholbarRoutinemäßiger Aufbau von Immunbibliotheken
LymphknotenModeratHoher Anteil reifer PlasmazellenAnreicherung hochaffiner Klone
MilzInvasivSehr hoch, breite RepräsentationProjekte mit maximalem Diversitätsbedarf
KnochenmarkModerat bis invasivLanglebige PlasmazellenReifes, zeitstabiles Antikörper-Repertoire
Protokoll

Extraktion unmittelbar nach der Entnahme durchgeführt.

01

Zellisolierung

PBL/PBMC werden direkt nach der Blutentnahme durch Dichtegradientenzentrifugation (z. B. Ficoll) isoliert.

02

Gesamt-RNA-Extraktion

Die Gesamt-RNA wird nach einer Referenzmethode (Guanidiniumthiocyanat-Phenol-Chloroform) extrahiert, ohne Verzögerung, um Abbau zu begrenzen.

03

Reverse Transkription

Die Boten-RNA wird durch Oligo(dT)-Priming in cDNA umgeschrieben, dem Ausgangspunkt für die nachfolgende Amplifikation des VHH-Repertoires.

04

Qualitätskontrolle

Jeder Extrakt wird vor der Freigabe quantifiziert und seine Integrität bewertet — siehe unsere Seite zur Qualitätskontrolle.

Kritischer Punkt — Die Extraktion erfolgt am selben Tag wie die Probenentnahme: Der RNA-Abbau beginnt bereits mit der Zelllyse, und jede Verzögerung verschlechtert den Integritätswert (RIN) der endgültigen Charge.
Fragen?

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Kontakt

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